1995年凭借与黄建新联合执导的喜剧电影《背靠背脸对脸》获得第15届中国电影金鸡奖最佳导演奖，这是杨亚洲执导的首部电影 。1997年11月8日与黄建新联合执导的喜剧电影《埋伏》上映，影片获第17届中国电影金鸡奖特别奖，并提名第47届柏林国际电影节金熊奖。1999年与黄建新联合执导喜剧电影《没事偷着乐》，影片获得2000年意大利远东国际电影节最佳故事片奖。2001年1月杨亚洲首次执导电视剧《空镜子》，这是根据作家万方的同名小说改编而成的 ，该剧获得第20届中国电视金鹰奖长篇电视剧优秀作品奖。6月执导的电视电影《大戏小戏》获首届中国电视电影百合奖一等奖 。2002年杨亚洲执导，倪萍、袁泉、孙海英主演的励志电影《美丽的大脚》被评为第22届中国电影金鸡奖最佳影片 ，影片关注西部农村教育出现的若干问题，包括教育经费的不足、女性教师地位低下以及贫困文化的滋生等 。杨亚洲也因此获得第9届中国电影华表奖优秀导演奖，以及第22届中国电影金鸡奖最佳导演奖 。2004年1月27日杨亚洲执导，彭玉，倪萍，朱媛媛主演的情感伦理剧《浪漫的事》在央视一套播出 ，该剧讲述了一家三姐妹在平凡的生活中寻找浪漫的爱情，当她们因为各种原因相继离婚后，三姐妹在母亲的婚礼上最终领悟到了浪漫的涵义 。杨亚洲因此获得第22届中国电视金鹰奖最佳导演，以及第24届中国电视剧飞天奖优秀导演奖 。5月4日美国世界艺术家协会向杨亚洲颁发了“杰出贡献奖”。2005年执导的第四部电影作品《泥鳅也是鱼》影片展现中国农民工爱情和尊严 ，并入围第18届东京国际电影节主竞赛单元-金爵奖 ，最终获第18届东京国际电影节最佳艺术贡献奖 。2007年执导的爱情伦理剧《大浴女》讲述一个横跨20年曲折、离奇的故事 。2009年2月23日执导的电影《没有语言的生活》上映，该片根据作家东西的同名中篇小说改编而成，影片的主人公是三个残缺之人，一个聋子、一个瞎子、一个哑巴，他们共同组成了一个“看不见，说不出，听不见”的家庭，过着没有语言的生活 。同年执导的电视剧《蝴蝶》在中国和加拿大两国的主流电视台同步播出 。2010年执导纪念汶川地震三周年的电影《大太阳》，凭借该片提名第11届中国长春电影节最佳导演奖。2012年与儿子杨博共同执导的电影《最长的拥抱》在蒙特利尔电影节上获得创意大奖 。2014年4月执导的家庭情感剧《嘿，老头！》在北京怀柔开机，6月底杀青。该剧于2015年3月26日在北京、东方卫视播出，凭借该剧提名第21届上海电视节白玉兰奖最佳导演奖，并获得第2届中美国际电视节最佳导演奖。2015年5月22日执导的电影《哺乳期的女人》上映，改编自作家毕飞宇获得首届鲁迅文学奖的同名短篇小说 。12月凭借执导的《草帽警察》获得第7届新农村电视艺术节-金牛奖最佳导演奖 。2016年执导家庭情感剧《嘿，孩子！》，该剧关注生孩子的话题 。