1991年斯派克·琼斯首度执导的短片《录像岁月》，该短片先后在美国多个独立电影节上展映。琼斯之后导演了大量的广告和MV。 1998年，此时的斯派克·琼斯已经在娱乐广告界混迹了7年时间之久，此时的他已经具备了执导剧情长片的足够功力，只是一直没有遇到合适的剧本。而与此同时，青年编剧查理·考夫曼的写出了一个名为《成为约翰·马尔科维奇》的剧本，这个剧本被好莱坞制片人斯蒂夫·高林给相中，高林看完剧本后当即拍板投资，并且邀请斯派克·琼斯作为这部影片的导演。邀请约翰·库萨克和卡梅隆·迪亚茨作为影片的男女主角，参与演出该片的明星还有：查理·辛、达斯汀·霍夫曼、约翰·马尔科维奇、布拉德·皮特等。 1999年，《成为约翰·马尔科维奇》顺利公映，影片耗资1300万美元，最终在北美地区获票房2286万美元。斯派克·琼斯在依靠《成为约翰·马尔科维奇》的成功之后，斯派克·琼斯还即兴玩起来电视电影，他在1999年拍摄了《托伦舞团》。 2002年，斯派克·琼斯又执导了查理·考夫曼编剧的电影《改编剧本》，影片有尼古拉斯·凯奇主演，和凯奇配戏的是梅丽尔·斯特里普。 2003年，斯派克·琼斯和特洛伊·米勒、杰克·布莱克等圈内好友合拍了喜剧《顽强的D：终极大师之作》，影片由六位导演联合执导，这同样是一部电视电影，影片的内容和结构比较疯狂。 2009年，斯派克·琼斯执导的奇幻片《野兽家园》上映第一周就登顶北美周末票房榜。《野兽家园》改编自同名的儿童画册。 2014年，斯派克·琼斯执导的电影《她》获第86届奥斯卡金像奖最佳原创剧本奖。编剧乔纳森·森德和萨钦·盖德二人控告琼斯，声称他导演的电影《她》是抄袭了他们的剧本《Belv》。4月3日法官最终判决斯派克·琼斯胜诉。